Проекты

Описание инициативы (проектной идеи)

Проект «Микробиота снежного барса (Panthera uncia) как инструмент мониторинга здоровья и сохранения вида» направлен на исследование микробиоты снежного барса и оценку возможности использования полученных характеристик в качестве дополнительного инструмента неинвазивного мониторинга состояния животных. Я планирую реализовать проект на базе АНО «Научно-исследовательский центр сохранения биоразнообразия “Снежный барс”» и развиваемого в Кыргызской Республике центра «Ак Илбирс», деятельность которых связана с изучением и сохранением снежного барса, мониторингом, ветеринарным сопровождением и научным сотрудничеством.

С 2014 года моя научная деятельность связана с молекулярно-биологическими исследованиями и изучением микробных сообществ. Я прошла путь от лаборанта Междисциплинарного центра протеомных исследований КФУ до старшего научного сотрудника. Владею методами молекулярной биологии и высокопроизводительного секвенирования ДНК. В моём опыте — шотган-метагеномика кишечника человека, исследования лактобактерий и Escherichia coli, трёхлетнее изучение микробиоты рек Куйбышевского водохранилища методом 16S рРНК, а также исследования микробиоты фазанов, перепелов и коров. Я участвовала в проектах РФФИ и РНФ, посвящённых микробиоте и дисбиозам, поэтому могу самостоятельно организовать исследование от получения биоматериала до анализа и депонирования данных.

Снежный барс относится к редким видам, а его небольшие и изолированные популяции требуют постоянного контроля состояния животных. Сегодня мониторинг в основном опирается на наблюдения, фотоловушки и следы жизнедеятельности. При этом микробиота может отражать особенности состояния организма и условий его существования, однако сопоставимых данных по природным популяциям снежного барса недостаточно. Проект позволит получить такие данные и определить характеристики микробного сообщества, перспективные для дальнейшего использования в мониторинге.

В рамках проекта я проведу полевые экспедиции и неинвазивный отбор биоматериала в районах обитания снежного барса. Образцы будут документироваться, сохраняться и транспортироваться для лабораторного исследования. Планируется получить не менее 20 образцов. В лаборатории я проведу выделение ДНК, амплификацию участка V3–V4 гена 16S рРНК и высокопроизводительное секвенирование. Затем выполню биоинформатическую обработку, таксономическую классификацию и анализ разнообразия микробиоты, включая показатели Chao1, Shannon и Simpson, а также сравнение микробных сообществ между территориями.

Результатом проекта станет структурированный массив данных о микробиоте снежного барса, включающий выявленные таксоны, характеристики разнообразия и результаты сравнительного анализа. На его основе я определю перспективные микробиотические показатели, которые в дальнейшем можно будет проверять как потенциальные маркеры состояния животных. Результаты будут оформлены в научной публикации, а полученные последовательности при соответствии техническим требованиям будут депонированы в международной базе NCBI SRA.

Достижение результата я смогу подтвердить количеством и качеством полученных образцов и последовательностей, полнотой таксономического и статистического анализа, сформированной базой данных и подготовленной публикацией. В дальнейшем полученные данные могут быть расширены за счёт новых территорий и образцов, включая исследования в Центральной Азии на базе центра «Ак Илбирс», что позволит формировать сравнительную научную основу для долгосрочного мониторинга и сохранения вида.