Проекты

Описание инициативы (проектной идеи)

Дальневосточный трепанг Apostichopus japonicus — промысловый обитатель прибрежных экосистем Приморья, Сахалина и южных Курил. Перелов и браконьерство сократили дикие группировки: в заливе Петра Великого численность остается ниже прежнего уровня, в заливе Анива запас составляет порядка 8–10 т и промышленный лов фактически ограничен научным изъятием, у мыса Докучаева в заповеднике «Курильский» добыча запрещена. Одновременно в море выпускают заводскую молодь, а для сахалино-курильских акваторий готовят перевозку производителей из Приморья. При этом для российских акваторий до сих пор недостаточно данных, позволяющих отличить естественную популяционную структуру от изменений, связанных с выпуском заводской молоди и переносом производителей между районами. Решение о выпуске принимается без генетической оценки риска для дикой группировки.
Проект рассчитан на 18 месяцев, с 1 марта 2027 года по 31 августа 2028 года. Основа — уже собранные 17 природных выборок, 391 особь, 2017–2025 годы: Приморье (бухта Воевода, мыс Красный, бухта Мраморная, бухта Северная, залив Восток, бухта Киевка), залив Анива, Кунашир, включая мыс Докучаева, и Шикотан. В сезон 2027 года к ним добавятся точки, которых не хватает для сравнения, в том числе районы выпуска молоди. Материал берут прижизненно, из амбулакральных ножек. Основным инструментом станет генотипирование по уже апробированной панели из 10 высокополиморфных микросателлитных локусов ядерной ДНК. Для этого вида надежная оценка структуры требует не менее девяти таких локусов. Рядом с дикими выборками будут стоять группы из районов выпуска и маточные стада партнеров, которые предоставляют образцы. Для каждой выборки будут рассчитаны частоты аллелей, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, показатели инбридинга и генетической дифференциации; будет проведен анализ популяционной структуры и возможных эффектов сокращения численности. Уже собранный материал и отработанные протоколы составляют собственный вклад. Грант оплачивает генотипирование и один полевой сезон.
К августу 2028 года будут готовы референсные генетические профили диких группировок, карта акваторий, где выпуск заводской молоди и перевозка производителей из другого района несут риск потери редких аллелей и смешения локальных групп, и письменные критерии такого риска. Профили и критерии передаются заповеднику «Курильский», ФГБУ «Земля леопарда» и Сахалинскому филиалу ВНИРО (СахНИРО), который ведет учет запаса в Южно-Курильской промысловой зоне Охотского моря. Хозяйство, предоставившее образцы, получает заключение по своим производителям только в части недопустимости выпуска генетически обедненной молоди в акваторию из перечня риска. Измеримый итог: профили не менее чем по 17 уже собранным выборкам и по выборкам районов выпуска и маточных стад, одна карта, один комплект критериев и подтверждение передачи не меньше чем двум партнерам охраны и учета запаса.
Научный задел заявителя основан также на результатах кандидатской диссертации, посвященной пространственной и временной изменчивости ядерной и митохондриальной ДНК A. japonicus в заливе Петра Великого. В предыдущих исследованиях уже оптимизированы протоколы амплификации микросателлитных локусов, апробированы методы статистического анализа популяционной структуры, разработан способ прижизненного получения генетического материала из амбулакральных ножек без ущерба для животных и экспериментально показано, что для надежной оценки популяционной структуры необходимо использовать не менее девяти высокополиморфных микросателлитных локусов.
У команды имеется необходимая приборная база для выделения ДНК, проведения ПЦР и фрагментного анализа, включая генетический анализатор, а также ранее апробированная панель высокополиморфных микросателлитных маркеров. Таким образом, основные экспериментальные и аналитические подходы проекта уже освоены коллективом, что существенно снижает методические риски и подтверждает его реализуемость в заявленные сроки.
ННЦМБ ДВО РАН предоставляет доступ к генетическому анализатору ABI 3130xl в центре коллективного пользования и водолазный сбор по действующему разрешению. Государственный природный заповедник «Курильский» — партнер по акватории мыса Докучаева и получатель профилей и критериев. ФГБУ «Земля леопарда» — партнер по акватории Дальневосточного морского заповедника в заливе Петра Великого и сопредельным точкам, получатель заключения по риску выпуска. Сахалинский филиал ВНИРО (СахНИРО) ведет учет запаса в Южно-Курильской промысловой зоне Охотского моря и получает профили для решений по изъятию. Приморский филиал ФГБУ «Главрыбвод» в бухте Северная, ООО «ГК Гольфстрим» в лагуне Буссе и ООО «Санди» предоставляют софинансирование, свои производственные мощности и площадку для осуществления мониторинга и применения результатов в производственной деятельности.